所谓的“一夜之间”只是形容玛雅人灭亡的神秘蹊跷，并不是说玛雅人真的是一夜之间就不存在了，而这种说法也使得部分人认为玛雅人不是地球人，已经离开了地球。

首先要说的是至今地球上仍然有人坚持以玛雅人后裔自居，而他们生活的地方也的确是当年玛雅人生活的地方，而且仍保持着一些古老的习俗和祭祀活动，但是有关玛雅人的历史他们自身也了解的不是很多，因为玛雅文明断绝了，那些以玛雅人后人自居的人也难以从玛雅石刻中获取足够信息，玛雅人数学、天文等成就也随着灭亡而断绝。尽管玛雅人灭亡的比较蹊跷，但是从玛雅石刻和周围找到的文明迹象可以知道，玛雅人的文明程度还比较低，多用石器而且尚未发明车轮等，生产力水平还比较低，没有任何高科技的迹象，仍处于石器时代。而且根据考古发现，玛雅人尽管曾经兴建了很多城邦，但是从未形成像秦、罗马那样的统一的帝国或者王朝，他们的衰落也经历了相当长的一段历史时期，约9世纪-16世纪玛雅文明逐渐式微，在周围新兴城市的影响下逐渐消亡，只留下了一个语言、文字、宗教信仰及习俗传统相似的文化圈。

由于玛雅人曾经创造的灿烂文明，玛雅人就那么悄无声息的消失的确令人难以理解，但是其实从几百年前就已经逐渐式微，在14世纪以后就没有新建的城市了，可见玛雅人内部已经有了很多问题，而欧洲人发现新大陆的时候已经是十五世纪的事情了，那个时候留下的已经是衰亡的玛雅文化圈了。现在研究玛雅历史的更多是欧美的学者，不同文化圈的人去研究几百年前已经逐渐灭亡的玛雅文明，当然会有很多难以理解的地方，造就了玛雅文明的神秘。关于玛雅文明的灭亡，科学家和考古学家们一致认为和其它古老的区域文明灭亡的原因差不多，无非是气候变化、外族入侵、人口爆炸、感染疾病等等，2018年新的研究认为，玛雅贵族醉心于享乐和天文等研究，而忽视了和下层人的沟通，加上气候灾难等事件，底层再也无法供应玛雅贵族的各种活动就矛了盾了，最后在周边城邦和自身的问题下导致人口流失文明断绝。

尽管玛雅文明神秘，但是却并没有超脱现代人的理解，而根据现代的眼光，玛雅人的很多成就还是很小儿科的，天文知识虽然还不错，但是不能指望用肉眼观测星象的古代人能有什么比现代天文观测更高深的发现。